จากกรณีที่ คณะกรรมาธิการบริหารราชการแผ่นดินสภานิติบัญญัติแห่งชาติ (สนช.) ตรวจสอบพบว่า กรมธนารักษ์ได้นำที่ราชพัสดุเนื้อที่ดิน 16 ไร่ 1 งาน 53 ตารางวา ตั้งอยู่ปลายรันเวย์ท่าอากาศยานนานาชาติเกาะสมุย จ.สุราษฎร์ธานี ให้บริษัทการบินกรุงเทพ จำกัด (บางกอกแอร์เวย์) เช่าที่ มีระยะเวลาการเช่า 30 ปี ตั้งแต่ปี 2542-2572 อาจเป็นการบุกรุกที่สาธารณะ เนื่องจากที่ดินมีลักษณะเป็นป่าพรุและไม่สามารถขึ้นทะเบียนเป็นที่ราชพัสดุได้ ซึ่งคณะทำงานแก้ปัญหาที่ดินสนามบินสมุย มีมติให้กรมธนารักษ์เพิกถอนที่ราชพัสดุ พร้อมจะยกเลิกสัญญาเช่าที่ดิน ภายใน 30 วัน นั้น
ล่าสุด วันที่ 4 กุมภาพันธ์ 2560 สายการบินบางกอกแอร์เวย์ส ออกหนังสือชี้แจง ยืนยันบริษัท การบินกรุงเทพ จำกัด (มหาชน) ในฐานะเจ้าของกรรมสิทธิ์สนามบินสมุย จะยังคงเปิดให้บริการสนามบินตามปกติ พร้อมชี้แจงว่า ก่อนสร้างสนามบินสมุย บริษัทนำส่งเอกสารสิทธิ์ที่ดินให้หน่วยงานราชการที่เกี่ยวข้องตรวจสอบและออกใบอนุญาตทั้งหมดแล้ว
